Clinical, Microbiome & Translational Research Scientist (PhD)

О позиции

Позиция направлена на применение экспертизы в области микробиомики, биоинформатики и клинических исследований для создания высокоточных учебных данных. Ваша работа напрямую повлияет на то, как модели учатся рассуждать и выполнять задачи в области биомедицинских наук.

Чем заниматься

• Разработка сложных научных задач экспертного уровня в области микробиома/метабаркодирования, клинической и трансляционной биоинформатики с чёткими проверяемыми решениями
• Оценка выходов ИИ-моделей на предмет научной точности, строгости и глубины рассуждений, выявление тонких ошибок, которые могли бы пропустить специалисты без профильного образования
• Создание детальных критериев оценки и эталонных ответов, основанных на первоисточниках и устоявшихся методологиях
• Применение экспертных знаний в областях 16S и shotgun метавомики, анализа вирусома и взаимодействия хост-микробиома, открытия биомаркеров, клинической геномики, персонализированной медицины на основе омикс-технологий
• Подготовка ясных письменных объяснений ходов рассуждений для проверки другими экспертами
• Соблюдение стандартов качества через итеративную обратную связь и рецензирование коллегами

Что ждут

• Докторская степень (PhD) в области микробиологии, биоинформатики, вычислительной биологии, биомедицинских наук, иммунологии, эпидемиологии или смежной области
• Опыт практических исследований в академической или промышленной лаборатории (влажное лабораторное оборудование является преимуществом)
• Профессиональное владение английским языком — письменным и устным (уровень C1 или выше)
• Знание инструментов анализа микробиома: QIIME2, Kraken2, MetaPhlAn, HUMAnN, сборка и binning MAG, анализ вирусома
• Опыт работы с TCGA, UK Biobank, исследованием биомаркеров, выживаемым анализом, интеграцией EHR + омикс-данных, онкогеномикой/иммунологической геномикой
• Владение статистикой и машинным обучением для высокомерных биологических данных
• Программирование: Python и/или R (обязательно), Bash, инструменты workflow-оркестрации
• Опыт рецензирования, бэнчмаркинга или написания научного контента
• Наличие публикаций, желательно первых авторов в профильных журналах

Условия

• Работа на глобальном рынке в области передовых ИИ-технологий для биомедицины
• Возможность напрямую влиять на развитие следующего поколения ИИ-систем
• Гибкий график и полная удалённость из любой точки мира
• Удалённая работа без географических ограничений
• Контакт с международными командами исследователей и разработчиков ИИ

Навыки

• Python
• R
• QIIME2
• Kraken2
• MetaPhlAn
• HUMAnN
• Bash
• Metagenomics
• Bioinformatics
• Machine Learning
• Survival Analysis
• TCGA
• UK Biobank
• Statistical Analysis
• Genomics
• MAG assembly
• Biomarker Discovery
• EHR Integration

Могут спросить на собеседовании

1. Как вы оцените научную корректность вывода ИИ-модели в области метагеномного анализа?
2. Опишите ваш подход к разработке контрольных вопросов для обучения ИИ-системы в конкретной области микробиомики.
3. Какие методы вы используете для верификации собственных результатов в многомерных биологических данных?